تقدم كلية العلوم 7 برامج للدراسات العليا: ماجستير في البيئة والتنمية المستدامة، والرياضيات، والفيزياء التطبيقية، والعلوم البيولوجية، وعلوم البيانات الضخمة والتحليل، والكيمياء البيئية، ودكتوراه في البيئة والتنمية المستدامة. تهدف الكلية إلى تعزيز برامجها للدراسات العليا من خلال تقديم برامج متعددة التخصصات بالتعاون مع مؤسسات وجامعات محترمة دوليًا. يتم تقديم برنامج الماجستير في علم البيانات الضخمة والتحليل بالتعاون بين كلية العلوم وكلية تكنولوجيا المعلومات. تم منح برنامجي الماجستير في البيئة والتنمية المستدامة وعلوم البيانات الضخمة والتحليل الثقة التامة عند مراجعتها في عام 2022م من قبل هيئة جودة التعليم والتدريب.